Ðiện Hòn Chén là nơi ngày xưa người Chàm thờ nữ thần PoInưNagar, sau đó người Việt theo Thiên Tiên Thánh Giáo tiếp tục thờ bà dưới xưng Thánh Mẫu Thiên Y A Na. Từ năm 1954, Liễu Hạnh Công Chúa, tức là Vân Hương Thánh Mẫu, gốc gác từ miền Bắc, cũng được đưa vào thờ ở đây. Ngoài ra, tại điện Hòn Chén, người ta còn có thờ Phật, thờ Thánh Quan Công và hơn 100 vị thần thánh khác thuộc vào hàng đồ đệ của các thánh thần nói trên. Vua Ðồng Khánh cũng là những đồ đệ ấy.